Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKAP4Q07065 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms