Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEUP1Q05D60 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEUP1Q05D60 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEUP1Q05D60 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms