Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP7AQ04656 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ATP7AQ04656 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ATP7AQ04656 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms