Protein–RNA interactions for Protein: Q04214

TY1B-MR1, Transposon Ty1-MR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-MR1Q04214 GSY1YFR015C 2127 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 PRO2YOR323C 1371 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 RGT1YKL038W 3513 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 NMD3YHR170W 1557 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 ARO80YDR421W 2853 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 TRX2YGR209C 315 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 SNU66YOR308C 1764 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 MAS1YLR163C 1389 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 CSC1YLR241W 2349 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 YJL215CYJL215C 360 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 YOR379CYOR379C 339 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 RXT3YDL076C 885 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 TAF11YML015C 1041 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 PUT1YLR142W 1431 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 THS1YIL078W 2205 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 YCR023CYCR023C 1836 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 ASA1YPR085C 1332 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 KAR2YJL034W 2049 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 PDX3YBR035C 687 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 LOS1YKL205W 3303 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 GTO1YGR154C 1071 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 TRP3YKL211C 1455 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 HST4YDR191W 1113 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 COA3YJL062W-A 258 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 TRS33YOR115C 807 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 KGD1YIL125W 3045 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 ARH1YDR376W 1482 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 ARC1YGL105W 1131 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 MTM1YGR257C 1101 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 MAL13YGR288W 1422 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1B-MR1Q04214 FAT3YKL187C 2253 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 HMS2YJR147W 1077 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 GMH1YKR030W 822 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 snR10snR10 245 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 PUS1YPL212C 1635 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 IRC22YEL001C 678 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 ALD6YPL061W 1503 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 GCN20YFR009W 2259 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 SFT2YBL102W 648 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 YMD8YML038C 1329 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 TFG1YGR186W 2208 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 KCC4YCL024W 3114 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 RCR2YDR003W 633 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 YCR061WYCR061W 1896 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 MPH2YDL247W 1830 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 CPR4YCR069W 957 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 SPG4YMR107W 348 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 APM2YHL019C 1818 nt6.77□□□□□ -1.32
TY1B-MR1Q04214 UBX7YBR273C 1311 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 SUL2YLR092W 2682 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 RPS4BYHR203C 786 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 RPS4AYJR145C 786 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 SOL1YNR034W 966 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 SFB3YHR098C 2790 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 MCM2YBL023C 2607 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 NTA1YJR062C 1374 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 HPM1YIL110W 1134 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 AIM21YIR003W 2040 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 SNF8YPL002C 702 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 UTP11YKL099C 753 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 CPS1YJL172W 1731 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 GLC3YEL011W 2115 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 CTR3YLR411W 726 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 RPC53YDL150W 1269 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 YDL228CYDL228C 642 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 MRS3YJL133W 945 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 ASN2YGR124W 1719 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 TRM11YOL124C 1302 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 CPR1YDR155C 489 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 MSC2YDR205W 2175 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 AST1YBL069W 1290 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 YOR131CYOR131C 657 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1B-MR1Q04214 GSY2YLR258W 2118 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 PCT1YGR202C 1275 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 YKL223WYKL223W 333 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 BIT2YBR270C 1638 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 TOS2YGR221C 1869 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 SGV1YPR161C 1974 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 IMD3YLR432W 1572 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 RSC2YLR357W 2670 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 MHF2YDL160C-A 243 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 OXP1YKL215C 3861 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 EPS1YIL005W 2106 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 CNN1YFR046C 1086 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 POR1YNL055C 852 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 SSB2YNL209W 1842 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 AKL1YBR059C 3327 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 RPL43BYJR094W-A 279 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 QCR2YPR191W 1107 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 TNA1YGR260W 1605 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 YIL055CYIL055C 1884 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 SIA1YOR137C 1869 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 YNR065CYNR065C 3351 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 ELP2YGR200C 2367 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 BUD25YER014C-A 462 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 YIL165CYIL165C 360 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 ADY3YDL239C 2373 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1B-MR1Q04214 YPL162CYPL162C 822 nt6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms