Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRB3Q04118 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms