Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR3Q03167 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGFBR3Q03167 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms