Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLH1Q02575 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms