Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTN2Q02246 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTN2Q02246 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms