Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFRSF17Q02223 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF17Q02223 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms