Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 CYK3YDL117W 2658 nt4.82□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 SHM1YBR263W 1473 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 SVF1YDR346C 1446 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 IMA1YGR287C 1770 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 SSY5YJL156C 2100 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 HXT4YHR092C 1731 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 RPT2YDL007W 1314 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 SFC1YJR095W 969 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 DCN1YLR128W 810 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YLR296WYLR296W 327 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YGP1YNL160W 1065 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 NRG2YBR066C 663 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 MRPL36YBR122C 534 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 EKI1YDR147W 1605 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 HFI1YPL254W 1467 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 APL6YGR261C 2430 nt4.81□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 DEG1YFL001W 1329 nt4.8□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 ADY2YCR010C 852 nt4.8□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.8□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.8□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 PDH1YPR002W 1551 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 RPT4YOR259C 1314 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 RTN1YDR233C 888 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 BUR6YER159C 429 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 GRX4YER174C 735 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 RAI1YGL246C 1164 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YLR036CYLR036C 612 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 PPA2YMR267W 933 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 ELA1YNL230C 1140 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 CSG2YBR036C 1233 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 NFI1YOR156C 2181 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YFL034WYFL034W 3222 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 SIA1YOR137C 1869 nt4.79□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 RAD57YDR004W 1383 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 THI22YPR121W 1719 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 PSE1YMR308C 3270 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YER010CYER010C 705 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 DSD1YGL196W 1287 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YIL060WYIL060W 435 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 SYN8YAL014C 768 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YET2YMR040W 483 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 YDL109CYDL109C 1944 nt4.78□□□□□ -1.64
SKO1Q02100 DNF2YDR093W 4839 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 STL1YDR536W 1710 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SOG2YOR353C 2376 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 LDB17YDL146W 1476 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PIC2YER053C 903 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YLR346CYLR346C 306 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YNL019CYNL019C 855 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YNL033WYNL033W 855 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YBL081WYBL081W 1107 nt4.77□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SAS10YDL153C 1833 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 VHS2YIL135C 1311 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ATH1YPR026W 3636 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 TRM8YDL201W 861 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PFA5YDR459C 1125 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MHO1YJR008W 1017 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PRM9YAR031W 897 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 RPS31YLR167W 459 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SNO1YMR095C 675 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SPG4YMR107W 348 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HOR7YMR251W-A 180 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ARG1YOL058W 1263 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ECM33YBR078W 1290 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SRB6YBR253W 366 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MPC54YOR177C 1395 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 UBA2YDR390C 1911 nt4.76□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ACF2YLR144C 2340 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 NRD1YNL251C 1728 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 TFG1YGR186W 2208 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HEM3YDL205C 984 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 GIR2YDR152W 798 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 NVJ1YHR195W 966 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YNG1YOR064C 660 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SEO1YAL067C 1782 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 BUL1YMR275C 2931 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ARN1YHL040C 1884 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 FRE3YOR381W 2136 nt4.75□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PMT5YDL093W 2232 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MPH2YDL247W 1830 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MRPL7YDR237W 879 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MOB2YFL034C-B 864 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 DAL3YIR032C 588 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 TAF4YMR005W 1167 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YBL044WYBL044W 369 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 DAL82YNL314W 768 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 EXO1YOR033C 2109 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 STE20YHL007C 2820 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MBP1YDL056W 2502 nt4.74□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HPF1YOL155C 2904 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SEC9YGR009C 1956 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PXA1YPL147W 2613 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 DBP8YHR169W 1296 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PGU1YJR153W 1086 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 VTA1YLR181C 993 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PIN2YOR104W 849 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HPC2YBR215W 1878 nt4.73□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ISR1YPR106W 1332 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SAS4YDR181C 1446 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HST1YOL068C 1512 nt4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms