Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEX3Q00994 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEX3Q00994 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEX3Q00994 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms