Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK16Q00536 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK16Q00536 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms