Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD3P84022 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD3P84022 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.9 ms