Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA4P83105 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA4P83105 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms