Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPS9P82933 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPS9P82933 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPS9P82933 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms