Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAE1P78406 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAE1P78406 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAE1P78406 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAE1P78406 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAE1P78406 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAE1P78406 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAE1P78406 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAE1P78406 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAE1P78406 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAE1P78406 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAE1P78406 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RAE1P78406 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms