Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEP78395 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms