Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT83P78385 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT83P78385 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT83P78385 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT83P78385 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT83P78385 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT83P78385 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT83P78385 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT83P78385 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT83P78385 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT83P78385 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT83P78385 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT83P78385 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT83P78385 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT83P78385 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT83P78385 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT83P78385 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT83P78385 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT83P78385 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms