Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBBP68871 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBBP68871 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBBP68871 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBBP68871 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBBP68871 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBBP68871 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBBP68871 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBBP68871 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HBBP68871 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBBP68871 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HBBP68871 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HBBP68871 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms