Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CSNK2BP67870 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2BP67870 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms