Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SKP1P63208 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SKP1P63208 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKP1P63208 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKP1P63208 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKP1P63208 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKP1P63208 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKP1P63208 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKP1P63208 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms