Protein–RNA interactions for Protein: P62917

RPL8, 60S ribosomal protein L8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL8P62917 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL8P62917 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL8P62917 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL8P62917 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL8P62917 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL8P62917 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL8P62917 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL8P62917 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL8P62917 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL8P62917 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL8P62917 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL8P62917 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL8P62917 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL8P62917 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms