Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LOXL3P58215 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LOXL3P58215 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.5 ms