Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BACE1P56817 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BACE1P56817 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BACE1P56817 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BACE1P56817 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BACE1P56817 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BACE1P56817 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BACE1P56817 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BACE1P56817 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BACE1P56817 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BACE1P56817 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BACE1P56817 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BACE1P56817 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BACE1P56817 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BACE1P56817 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BACE1P56817 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BACE1P56817 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BACE1P56817 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BACE1P56817 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BACE1P56817 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BACE1P56817 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BACE1P56817 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BACE1P56817 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BACE1P56817 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BACE1P56817 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BACE1P56817 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BACE1P56817 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BACE1P56817 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BACE1P56817 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BACE1P56817 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BACE1P56817 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BACE1P56817 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BACE1P56817 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BACE1P56817 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BACE1P56817 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BACE1P56817 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BACE1P56817 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BACE1P56817 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BACE1P56817 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BACE1P56817 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BACE1P56817 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BACE1P56817 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms