Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA1P56199 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms