Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL23P55773 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL23P55773 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL23P55773 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL23P55773 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL23P55773 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL23P55773 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL23P55773 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL23P55773 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL23P55773 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL23P55773 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL23P55773 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL23P55773 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL23P55773 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL23P55773 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL23P55773 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL23P55773 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL23P55773 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL23P55773 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL23P55773 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL23P55773 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCL23P55773 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCL23P55773 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCL23P55773 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCL23P55773 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL23P55773 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCL23P55773 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms