Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC13P55735 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC13P55735 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC13P55735 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC13P55735 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC13P55735 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC13P55735 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC13P55735 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC13P55735 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC13P55735 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC13P55735 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC13P55735 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC13P55735 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC13P55735 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC13P55735 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC13P55735 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC13P55735 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC13P55735 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC13P55735 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC13P55735 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC13P55735 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC13P55735 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC13P55735 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC13P55735 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC13P55735 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC13P55735 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms