Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP14P54578 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP14P54578 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP14P54578 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP14P54578 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP14P54578 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP14P54578 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP14P54578 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP14P54578 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP14P54578 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP14P54578 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP14P54578 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP14P54578 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP14P54578 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP14P54578 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP14P54578 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP14P54578 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP14P54578 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP14P54578 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP14P54578 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP14P54578 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP14P54578 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP14P54578 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP14P54578 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP14P54578 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP14P54578 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP14P54578 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP14P54578 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP14P54578 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP14P54578 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP14P54578 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP14P54578 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP14P54578 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP14P54578 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP14P54578 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP14P54578 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP14P54578 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP14P54578 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
USP14P54578 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP14P54578 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP14P54578 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP14P54578 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP14P54578 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP14P54578 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP14P54578 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP14P54578 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms