Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNB3P54284 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNB3P54284 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms