Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTBP53611 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTBP53611 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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