Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP98P52948 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP98P52948 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP98P52948 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP98P52948 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP98P52948 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP98P52948 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP98P52948 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP98P52948 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP98P52948 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP98P52948 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP98P52948 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP98P52948 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP98P52948 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP98P52948 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP98P52948 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP98P52948 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP98P52948 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP98P52948 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP98P52948 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP98P52948 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP98P52948 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP98P52948 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP98P52948 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP98P52948 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP98P52948 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP98P52948 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP98P52948 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP98P52948 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP98P52948 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP98P52948 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP98P52948 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP98P52948 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP98P52948 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NUP98P52948 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP98P52948 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP98P52948 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP98P52948 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP98P52948 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP98P52948 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP98P52948 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP98P52948 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP98P52948 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP98P52948 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms