Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN5P51795 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN5P51795 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN5P51795 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN5P51795 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN5P51795 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN5P51795 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCN5P51795 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCN5P51795 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms