Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SMARCA4P51532 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA4P51532 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA4P51532 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms