Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAMP50895 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAMP50895 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAMP50895 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAMP50895 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAMP50895 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCAMP50895 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAMP50895 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAMP50895 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAMP50895 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAMP50895 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAMP50895 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAMP50895 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAMP50895 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAMP50895 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAMP50895 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAMP50895 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCAMP50895 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCAMP50895 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCAMP50895 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAMP50895 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAMP50895 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAMP50895 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAMP50895 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAMP50895 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAMP50895 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAMP50895 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAMP50895 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAMP50895 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAMP50895 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAMP50895 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAMP50895 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAMP50895 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAMP50895 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAMP50895 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAMP50895 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms