Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIG4P49917 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIG4P49917 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIG4P49917 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG4P49917 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG4P49917 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG4P49917 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG4P49917 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG4P49917 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG4P49917 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG4P49917 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG4P49917 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG4P49917 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG4P49917 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LIG4P49917 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIG4P49917 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG4P49917 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG4P49917 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG4P49917 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG4P49917 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG4P49917 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG4P49917 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG4P49917 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG4P49917 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG4P49917 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG4P49917 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG4P49917 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG4P49917 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG4P49917 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG4P49917 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG4P49917 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms