Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPFP49454 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPFP49454 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPFP49454 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPFP49454 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPFP49454 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPFP49454 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPFP49454 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPFP49454 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPFP49454 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPFP49454 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPFP49454 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPFP49454 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPFP49454 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPFP49454 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPFP49454 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPFP49454 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPFP49454 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPFP49454 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPFP49454 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPFP49454 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPFP49454 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPFP49454 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPFP49454 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPFP49454 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPFP49454 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPFP49454 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPFP49454 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPFP49454 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms