Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK8P49336 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK8P49336 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK8P49336 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK8P49336 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK8P49336 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK8P49336 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK8P49336 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK8P49336 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK8P49336 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK8P49336 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK8P49336 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK8P49336 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK8P49336 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK8P49336 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK8P49336 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK8P49336 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK8P49336 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK8P49336 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK8P49336 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK8P49336 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK8P49336 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK8P49336 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK8P49336 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK8P49336 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK8P49336 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK8P49336 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK8P49336 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK8P49336 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK8P49336 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK8P49336 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms