Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNI2P48788 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNI2P48788 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms