Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1DP48730 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK1DP48730 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1DP48730 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms