Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCP4P48539 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCP4P48539 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCP4P48539 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCP4P48539 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCP4P48539 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCP4P48539 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.9 ms