Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX9P48436 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX9P48436 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX9P48436 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX9P48436 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX9P48436 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX9P48436 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX9P48436 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX9P48436 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX9P48436 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX9P48436 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX9P48436 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX9P48436 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX9P48436 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX9P48436 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX9P48436 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX9P48436 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX9P48436 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX9P48436 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX9P48436 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX9P48436 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX9P48436 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX9P48436 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX9P48436 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX9P48436 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX9P48436 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX9P48436 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX9P48436 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms