Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TM4SF4P48230 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM4SF4P48230 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms