Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A9P48067 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms