Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPD2P43304 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPD2P43304 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPD2P43304 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPD2P43304 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPD2P43304 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPD2P43304 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPD2P43304 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPD2P43304 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPD2P43304 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPD2P43304 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPD2P43304 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPD2P43304 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPD2P43304 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPD2P43304 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPD2P43304 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPD2P43304 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPD2P43304 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPD2P43304 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms