Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTGFRP43088 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRP43088 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.9 ms