Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSG1P42857 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSG1P42857 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSG1P42857 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSG1P42857 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSG1P42857 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSG1P42857 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSG1P42857 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSG1P42857 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSG1P42857 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSG1P42857 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSG1P42857 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSG1P42857 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSG1P42857 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSG1P42857 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSG1P42857 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSG1P42857 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSG1P42857 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSG1P42857 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSG1P42857 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSG1P42857 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSG1P42857 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSG1P42857 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSG1P42857 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSG1P42857 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSG1P42857 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSG1P42857 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSG1P42857 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSG1P42857 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSG1P42857 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSG1P42857 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms