Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAA2P42765 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACAA2P42765 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms