Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSKP41240 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSKP41240 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSKP41240 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSKP41240 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSKP41240 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSKP41240 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSKP41240 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSKP41240 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSKP41240 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSKP41240 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSKP41240 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSKP41240 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSKP41240 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSKP41240 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms