Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPHP41219 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPHP41219 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPHP41219 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPHP41219 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPHP41219 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPHP41219 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPHP41219 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPHP41219 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPHP41219 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPHP41219 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPHP41219 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPHP41219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPHP41219 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPHP41219 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPHP41219 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPHP41219 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPHP41219 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPHP41219 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPHP41219 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPHP41219 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPHP41219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPHP41219 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPHP41219 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms