Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX19P40855 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX19P40855 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX19P40855 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX19P40855 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX19P40855 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX19P40855 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX19P40855 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX19P40855 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX19P40855 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX19P40855 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX19P40855 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX19P40855 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX19P40855 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX19P40855 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX19P40855 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX19P40855 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX19P40855 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX19P40855 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX19P40855 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX19P40855 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX19P40855 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX19P40855 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX19P40855 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX19P40855 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms